口腔内科学系的前身是华西协合大学牙的牙体学、牙周病学、小儿牙科，建于1917年。1954年，按苏联口腔医学教育模式，由龋病学、牙髓病学、牙周病学、口腔黏膜病学组建成口腔内科学教研室。2007年，成立了口腔内科学系，设有龋病学、牙髓病学、牙周病学、口腔黏膜病学、儿童口腔医学、老年口腔医学、口腔预防医学七个教研室;以及牙体牙髓科、牙周科、口腔黏膜科、儿童口腔科、老年口腔科、口腔预防科6个临床科室。2011年儿童口腔医学教研室、儿童口腔科调整并入口腔正畸学系。口腔内科学系是我国口腔常见病、多发病防治、研究和人才培养的重要基地，现为国家级重点学科、卫生部临床重点建设学科，拥有国家级精品课程、国家级精品资源共享课各2门，国家临床重点专科3个。

　　口腔内科学系现有在编职工138人，其中博士生导师12人，硕士生导师17人， 教授/主任医师 21人， 副教授/副主任医师28人，讲师/主管护师35人，护师54人。拥有国家级教学名师2人、国家有突出贡献的中青年专家1人、国家杰出青年基金获得者1人 、国家自然基金优秀青年基金获得者1人、教育部跨(新)世纪人才6人、国家全国百篇优秀博士论文的获得者1人。

　　先后获得国家科技进步二等奖1项、部省级科技进步一等奖7项、全国创新争先奖状1人。口腔内科学系党支部多次获成都市、四川大学“先进基层党组织”称号。